各地醫(yī)療費用的結(jié)算程序不同，結(jié)算標(biāo)準(zhǔn)和辦法不同，付費方法不同，但歸納起來無外乎兩種結(jié)算方式：

一是采用預(yù)付制。

二是采用后付制。預(yù)付制是指在醫(yī)療服務(wù)發(fā)生之前，醫(yī)療保險機(jī)構(gòu)向定點醫(yī)療機(jī)構(gòu)或用人單位按一定的標(biāo)準(zhǔn)預(yù)先支付費用。采用預(yù)付制結(jié)算辦法的，醫(yī)療保險機(jī)構(gòu)根據(jù)與定點醫(yī)療機(jī)構(gòu)和用人單位簽訂的職工醫(yī)療保險合同或根據(jù)地方政府的有關(guān)規(guī)定，通過“暫付款”科目將所需款項付給醫(yī)療保險機(jī)構(gòu)和用人單位，借記“暫付款”科目，貸記“銀行存款??支出戶”科目。

定期報銷時，按照規(guī)定的醫(yī)療保險費開支范圍和標(biāo)準(zhǔn)，審核醫(yī)療保險享受人員的醫(yī)療費支出數(shù)和用人單位醫(yī)療保險費報銷數(shù)額，借記“社會統(tǒng)籌醫(yī)療基金支出”、“個人帳戶醫(yī)療基金支出”、“離休人員醫(yī)療基金支出”科目，貸記“暫付款”科目。后付制是指醫(yī)療服務(wù)發(fā)生以后，根據(jù)服務(wù)發(fā)生的費用或者服務(wù)發(fā)生的量進(jìn)行付費的方式。

采用后付制結(jié)算辦法的，先由醫(yī)療機(jī)構(gòu)和用人單位墊付，報銷時，醫(yī)療保險機(jī)構(gòu)按規(guī)定的開支范圍和標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行審核，將款項付給定點醫(yī)療機(jī)構(gòu)和用人單位，借記“社會統(tǒng)籌醫(yī)療基金支出”、“個人帳戶醫(yī)療基金支出”、“離休人員醫(yī)療基金支出”科目，貸記“銀行存款??支出戶”科目。